Pater Generaal bij de Paus
Op zaterdag, 27 januari 2008, één week na zijn verkiezing tot 29ste opvolger van Ignatius van Loyola, heeft pater Nicolás een eerste privéaudiëntie gehad bij Paus Benedictus XVI.

Na een korte fotosessie hebben beiden een hartelijk en vriendschappelijk gesprek gehad. De Heilige Vader was verheugd te horen dat de Algemene Congregatie een commissie had gevormd om zijn brief aan pater Peter-Hans Kolvenbach, de vorige Algemene Overste, te bestuderen. Vervolgens werd er gesproken over Japan waar pater Nicolás 33 jaar heeft gewerkt.

De Heilige Vader vroeg aan de Generale Overste om verder te werken aan de dialoog met de cultuur en aan de evangelisatie alsook om te zorgen voor een degelijke vorming van de jonge jezuïeten. De nieuwe Generaal nam de gelegenheid te baat om zijn persoonlijke achting en die van de hele Sociëteit van Jezus voor de Plaatsvervanger van Christus opnieuw te bevestigen. Het was ook het ogenblik om het verlangen te bevestigen van de Sociëteit om Kerk in de hele wereld te dienen.
Vervolgens zei pater Nicolás dat de jezuïeten de gewoonte hebben dat de nieuw verkozen Algemene Overste zijn geloften vernieuwt tegenover de Paus. Pater Kolvenbach had dit schriftelijk gedaan. Daarom had ook pater Nicolás zijn geloften uitgeschreven, en hij had de envelopje bij zich. De Paus opende meteen de enveloppe en las de geloften. Daarop zei hij, “Dit is een goede gewoonte.”